Στον ελλαδικό χώρο η Ιόνιος Ακαδημία που λειτουργούσε από τις πρώτες δεκαετίες του 19ου αι. στην Κέρκυρα ως εκπαιδευτικό ίδρυμα πανεπιστημιακού επιπέδου, πλαισιώθηκε από τέσσερα μουσεία: αρχαιολογίας και καλλιτεχνίας, φυσικής ιστορίας, ανατομίας, χημείας και φυσικής καθώς και βοτανικό κήπο» [Ευριδίκη Αντζουλάτου-Ρετσίλα, Από το «μικρό και φιλόξενο» στο «μεγάλο και επιβλητικό»: Καταγράφοντας μουσειακές τροχιές, Επιστημονική Επετηρίς 1 (2016) 30].

Σχεδόν δύο αιώνες μετά, τον Ιανουάριο του 2019, ιδρύθηκαν οι Μουσειακές Συλλογές του Ιονίου Πανεπιστημίου με στόχο την υποστήριξη του εκπαιδευτικού έργου των σχολών και των τμημάτων του Ιονίου Πανεπιστημίου σε προπτυχιακό και μεταπτυχιακό επίπεδο, ενισχύοντας την επιστημονική έρευνα και τη μετάδοση της γνώσης τόσο στην πανεπιστημιακή κοινότητα όσο και στο ευρύ κοινό. Επιπλέον, ο νέος μουσειακός οργανισμός στοχεύει στην ανάδειξη των ποικίλων θεμάτων προβολής και διαχείρισης της πολιτιστικής κληρονομιάς μέσα από τη στενή συνεργασία με τους πολιτιστικούς φορείς και την κοινωνία των Ιονίων Νήσων.