Στην απόφαση ίδρυσης των «Μουσειακών Συλλογών Ιονίου Πανεπιστημίου», που δημοσιεύτηκε στην Εφημερίδα της Κυβερνήσεως (Φ.Ε.Κ. 144/29.01.2019/τ.Β’) τον Ιανουάριο του 2019, ορίζονται και οι συλλογές οι οποίες περιλαμβάνονται στο νέο Μουσείο και οι οποίες είναι οι εξής:

• Συλλογή Τυπογραφίας.
• Συλλογή Ιστορίας του Σχολείου και της Εκπαίδευσης «Στέφανος Γ. Πρίφτης».
• Συλλογή ψηφιακού Πολιτισμού και Τεχνών.

Διαχείριση συλλογών

Η διαχείριση των συλλογών του Μουσείου ακολουθεί τα διεθνή και ευρωπαϊκά πρότυπα διαχείρισης και αναφέρεται αναλυτικά στο συνημμένο αρχείο.

Οι Συλλογές του Μουσείου οργανώνονται και κατατάσσονται κατά θεματικές περιοχές στα γνωστικά πεδία των αντίστοιχων επιστημονικών ενοτήτων.
Πρωταρχική υποχρέωση του Μουσείου είναι η διατήρηση της καλής κατάστασης των Μόνιμων Συλλογών του και η εξασφάλιση κατάλληλων συνθηκών αξιοποίησης και έκθεσης των αντικειμένων των συλλογών.
Για τις μόνιμες συλλογές τηρούνται αρχεία καταγραφών, φωτογραφιών και άλλου υλικού τεκμηρίωσης. Η τεκμηρίωση αφορά στη συμβατική και ψηφιοποιημένη διαδικασία συλλογής, οργάνωσης, αποθήκευσης και διακίνησης του πληροφοριακού υλικού.
Το Μουσείο στεγάζεται σε χώρους του Ιονίου Πανεπιστημίου και εν γένει σε χώρους που διαχειρίζεται το Ιόνιο Πανεπιστήμιο.
Την ευθύνη φύλαξης και συντήρησης αντικειμένων του Μουσείου φέρουν τα θεσμοθετημένα αρμόδια όργανα του Ιονίου Πανεπιστημίου.